Za obavljanje poslova iz delokruga Ministarstva zaštite životne sredine obrazuju se sledeće osnovne unutrašnje jedinice:

• Sektor za finansijsko upravljanje i kontrolu
• Sektor za upravljanje životnom sredinom
• Sektor za zaštitu prirode i klimatske promene
• Sektor za strateško planiranje, projekte, međunarodnu saradnju i evropske integracije
• Sektor za upravljanje otpadom i otpadnim vodama
• Sektor za nadzor i preventivno delovanje u životnoj sredini

POSEBNE UNUTRAŠNJE JEDINICE

• Kabinet Ministra
• Sekretarijat Ministarstva
• Odsek za upravne i upravno-nadzorne poslove
• Grupa za internu reviziju